Après des études aux Beaux-Arts de Bordeaux puis au Studio national des arts contemporains - Le Fresnoy, Sébastien Betbeder réalise plusieurs films courts, puis son premier long métrage Nuage. Depuis, il continue d'alterner les formats passant librement du court au long, avec notamment 2 automnes, 3 hivers, Inupiluk pour lequel il reçoit le prix Jean Vigo, ou encore Le Voyage au Groenland et Tout fout le camp. En parallèle, il écrit des fictions pour France Culture, réalise des clips et des cartes blanches pour le programme d'ARTE, Blow up.
Son dernier film, Mimi de Douarnenez, est disponible sur KuB.